當(dāng)前位置:首頁 > 科研合作 > 數(shù)字PCR系列
Research Cooperation
科研合作
根據(jù)國(guó)家癌癥中心數(shù)據(jù),我國(guó)宮頸癌年新發(fā)15萬例,死亡5.5萬例,發(fā)病例數(shù)和死亡例數(shù)都超過了其他婦科腫瘤的總和[1]。絕大多數(shù)宮頸癌由高危HPV(hrHPV)持續(xù)感染所致,病毒的E6和E7基因可能與宿主DNA發(fā)生整合。hrHPV通常包括14種型別,其中16、18型的合計(jì)占比超過70% [2]。除宮頸癌以外,頭頸部鱗癌、肛門癌、陰道癌、外陰癌等癌種均有一定比例是由HPV感染所致。
循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)是腫瘤組織、細(xì)胞等釋放到循環(huán)系統(tǒng)中的腫瘤基因組片段,整合到宿主基因組中的HPV也以ctDNA的形式釋放[3]。已有多部指南共識(shí)推薦ctDNA用于分子殘留病灶(MRD)評(píng)估,ctHPV在總游離DNA中不受野生型背景的干擾,比點(diǎn)突變更容易檢測(cè)和鑒別。
已有多項(xiàng)研究將ctHPV用于宮頸癌、口咽癌的預(yù)后和監(jiān)測(cè),研究發(fā)現(xiàn)達(dá)到治療終點(diǎn)時(shí)和/或監(jiān)測(cè)過程中ctHPV陽性的患者生存數(shù)據(jù)更差,而且ctHPV較常規(guī)方法可提前發(fā)現(xiàn)復(fù)發(fā)[4-5]。其他一些研究提示基于數(shù)字PCR(ddPCR)法的ctHPV檢測(cè)靈敏度優(yōu)于熒光定量PCR(qPCR)法[6]。ddPCR法的檢測(cè)性能與基于高通量測(cè)序的HPV-seq相近[7],且檢測(cè)方法簡(jiǎn)便,成本更低。
ctHPV在宮頸癌監(jiān)測(cè)中的性能[4]
左圖:治療后ctHPV陽性與更短的PFS相關(guān)(p<0.0001);
右圖:ctHPV監(jiān)測(cè)到可能復(fù)發(fā)的時(shí)間較臨床確診復(fù)發(fā)的時(shí)間平均提前10個(gè)月(2~15個(gè)月)。
[1] https://doi.org/10.1016/j.jncc.2024.01.006
[2] 人乳頭狀瘤病毒核酸檢測(cè)用于宮頸癌篩查中國(guó)專家共識(shí)(2022)
[3] Int J Cancer. 2023 Jun 1;152(11):2232-2242.
[4] Clin Cancer Res. 2021 Nov 1;27(21):5869-5877.
[5] J Clin Oncol. 2020 Apr 1;38(10):1050-1058.
[6] J Pathol Clin Res. 2016 Jun 28;2(4):201-209.
[7] J Clin Oncol. 2023 Nov 16:JCO2300954.
[8] ESMO Open. 2021 Jun;6(3):100154.
項(xiàng)目名稱 | 適配機(jī)型 | 項(xiàng)目規(guī)格 | 樣本類型 | 送檢報(bào)告周期 |
人ctHPV 16定量檢測(cè) | Bio-Rad:QX200等 | 48測(cè)試/盒 | 外周血 (游離DNA保存管保存) | 3個(gè)工作日 |
人ctHPV 18定量檢測(cè) |
注:僅供科研參考使用,16/18型復(fù)合感染患者需同時(shí)進(jìn)行兩項(xiàng)檢測(cè)。
適用于因HPV 16型/18型感染導(dǎo)致的宮頸癌、頭頸部鱗癌等癌種患者:
(1)輔助預(yù)測(cè)治療效果:多個(gè)研究證實(shí),達(dá)到治療終點(diǎn)時(shí)和/或監(jiān)測(cè)過程中出現(xiàn)ctHPV陽性的患者無進(jìn)展生存(PFS)、無疾病生存(DFS)、總生存(OS)等數(shù)據(jù)更差[4-5][8];
(2)達(dá)到治療終點(diǎn)后的復(fù)發(fā)監(jiān)測(cè):ctHPV較常規(guī)方法可提前提示復(fù)發(fā),宮頸癌患者檢測(cè)到可能復(fù)發(fā)的時(shí)間較臨床確診復(fù)發(fā)的時(shí)間平均提前10個(gè)月,口咽癌患者平均提前6.6個(gè)月[4-5]。
治療前 | 治療期間 | 監(jiān)測(cè) |
確診后、治療前的任意時(shí)間 (活檢后最好間隔7天) 采集基線數(shù)據(jù) | 達(dá)到治療終點(diǎn)時(shí) (最后一次治療結(jié)束后的7~14天) 再次進(jìn)行檢測(cè) | 治療后1~3年內(nèi),每三個(gè)月監(jiān)測(cè)一次 |
治療后4~5年內(nèi),每六個(gè)月監(jiān)測(cè)一次 | ||
治療6年后,每年監(jiān)測(cè)一次 |
技術(shù)領(lǐng)先:ctHPV用于MRD檢測(cè),可以輔助預(yù)測(cè)治療效果,更可以提早數(shù)月提示疾病復(fù)發(fā);
靈敏度高:采用ddPCR的方法,檢測(cè)限低至每反應(yīng)1~3個(gè)拷貝,靈敏度優(yōu)于qPCR法;
特異性強(qiáng):檢測(cè)整合后的人類ctHPV,不與正常人類基因組和其他12個(gè)hrHPV型別出現(xiàn)交叉干擾;
檢測(cè)快速:實(shí)驗(yàn)操作簡(jiǎn)便,報(bào)告周期和檢測(cè)成本均優(yōu)于HPV-seq檢測(cè),普惠可及。
1.核酸提取
2.微滴制備
3.擴(kuò)增
4.數(shù)據(jù)分析
5.出具報(bào)告
1.咨詢相關(guān)事項(xiàng)
2.進(jìn)行樣本取樣
3.樣本快遞至飛朔檢測(cè)點(diǎn)
4.上機(jī)檢測(cè)
5.出具報(bào)告
6.報(bào)告送出
7.提供專業(yè)咨詢和疑惑解答
—— 僅供科研參考使用 ——