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PLATFORM INTRODUCTION
平臺介紹
科研合作
平臺介紹
末端修飾-單堿基延伸法TM-SBE:當所需檢測的DNA濃度極低時(例如cffDNA和CTC),可用生物素標記的ddNTP作SBE的底物,成功延伸的片段可以被avidin耦聯(lián)的磁珠吸附,從而富集,達到所需的檢測濃度。
技術(shù)原理
質(zhì)譜:試樣中的組分在離子源中發(fā)生電離,形成不同荷質(zhì)比的帶電離子,經(jīng)加速電場作用形成離子束,先后轟擊在檢測器,并經(jīng)電腦收集計算得到對應譜圖。
核酸質(zhì)譜的技術(shù)優(yōu)勢
基于SBE和MALDI-TOF MS搭建的massarray核酸質(zhì)譜系統(tǒng),在樣本選擇、實驗耗時、花費、結(jié)果準確性和可重復性等方面,均有很大的優(yōu)勢 。
1、高靈活性和可擴展性
可選購預裝的檢測panel,也可以自行通過agena網(wǎng)站的ADS線上程序設計多重引物組合,最高40重。有24、96、384孔可供選擇。
2、適用多種樣本,靈敏度和準確度高
一輪擴增子長度80-120bp,起始DNA量可低至5pg,cfDNA、FFPE等低溶度、片段化的模板均適用。SBE和質(zhì)譜技術(shù)的結(jié)合,使檢測結(jié)果可信度顯著上升
3、時間成本和經(jīng)濟成本低
所用引物無需特殊標記,操作過程同板同孔,中間無轉(zhuǎn)板和純化步驟,自動化程度高,手動操作時間短,8小時即可完成最多2快384孔板的檢測
4、結(jié)果自動分析,實驗可重復性高
系統(tǒng)自帶的Typer軟件,能夠自動解析譜圖,給出完善的分析結(jié)果。相較熒光PCR,質(zhì)譜通過讀取核酸的分子量,從而提供一種更加準確、重復性高的試驗方法
應用
NGS的完美搭檔:由于MassARRAY系統(tǒng)兼容各種來源和質(zhì)量的DNA樣品,且相比NGS,操作更加簡便,時間和經(jīng)濟花費更少,因此,是使用NGS檢測前,對核酸樣品進行質(zhì)控和鑒定的優(yōu)先選擇。